> 　C:\Program Files\NTEDIT\ntedit.iniに書き込めません。
>
> 　やりたい事は、「全てのファイル(*.*)」を一番上に持ってきたいという事なんですが。

OSが何か解りませんが、管理者として実行して下さい。
ProgramFilesフォルダ内のファイルにアクセスするときは、管理者権限が必要です。

参考サイト
https://helpx.adobe.com/jp/x-productkb/global/230789.html

または、鍋エディタのインストールフォルダを、
C:\Bin\NTEDIT 等に変更すると回避できます。
この問題（ユーザーアカウント制御の仕様）の為に、鍋ＣＡＤ等のインストールフォルダは、
C:\NTCAD を激しく推奨しているんです。